胚の発生に伴い、幹細胞は多様な転写プロファイルを持つ明確な細胞系統へと分化します。転写因子は、細胞型の特定と細胞機能の維持のために遺伝子発現を制御します。1 異なる発生段階における異なる細胞集団のトランスクリプトームを理解することは、細胞運命を解明するために不可欠です。
近年のシングルセル RNA シーケンシング（scRNA-seq）の進歩により、細胞分化を促進するトランスクリプトミクスを研究できるようになり、様々な細胞種の発生動態に関する貴重な知見が得られます。この強力なツールのおかげで、多くの生物医学的発見がもたらされました。また、scRNA-seq は希少で未解析の細胞のトランスクリプトミクスシグネチャーを特定できるため、疾患研究に革命をもたらすでしょう。しかしながら、発生過程における様々な細胞系統のトランスクリプトミクスシグネチャーはほとんど解明されていません
