ゼブラフィッシュスクリーニングは、生体内における低分子表現型薬物スクリーニングにおいて並外れた可能性を秘めており、ヒト疾患の優れたモデルとしても有用です。1組の繁殖ペアから数百個の胚を作製できます。ゼブラフィッシュは発生が早く、透明性が高いため、通常は細胞培養に限定される顕微鏡検査によるスクリーニング法に適しています。他の生体内スクリーニング技術とは異なり、数千匹の動物を数日間で撮影できるため、無傷の生体動物を用いたスクリーニングの利点を備えながら、比較的ハイスループットなスクリーニングが可能になります。
